RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000115302.1

Cldn16-201, Transcript of Claudin-16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn16, Length 950 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pex3Q9QXY9 372 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Morc1Q9WVL5 950 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa8.34□□□□□ -1.07
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ccdc112A0AUP1 442 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pramel3A2AHA7 463 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm7903A2AWL1 463 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Krt36B1AQ75 473 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 DgkiD3YWQ0 1071 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Krt78E9Q0F0 1068 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm3164L7N2B9 238 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Vmn2r71L7N2D8 855 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Vmn2r53L7N473 806 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Tpd52l1O54818 204 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Msh3P13705 1091 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Fgfr1P16092 822 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Tal1P22091 329 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 IppP28575 584 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lrrc55Q3UY51 311 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Wdr93Q402B2 695 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Xkr4Q5GH67 647 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Usp28Q5I043 1051 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Q5XFZ0 217 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 LbpQ61805 481 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Znf653Q6YND2 615 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Crb2Q80YA8 1282 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Haus7Q8BKT8 364 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm9913Q8BQQ2 135 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Slc38a7Q8BWH0 463 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mettl24Q8CCB5 363 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mamdc2Q8CG85 686 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 OtoaQ8K561 1137 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Upb1Q8VC97 393 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Vps16Q920Q4 839 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dqx1Q924H9 718 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Clstn3Q99JH7 956 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Krt82Q99M74 516 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Josd2Q9CR30 188 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rab27aQ9ERI2 221 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cnpy2Q9QXT0 182 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Polg2Q9QZM2 459 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rad9aQ9Z0F6 389 aa8.33□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Taf1Q80UV9 1891 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ttll6A4Q9E8 822 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 PotegA5H0M4 473 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Slc16a6B1AT66 607 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Tmem240B2RWJ3 173 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 GclmO09172 274 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Surf1P09925 306 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pou3f2P31360 445 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Col9a2Q07643 688 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Echdc2Q3TLP5 296 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gse1Q3U3C9 1213 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 E2f8Q58FA4 860 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Xkr5Q5GH66 676 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Islr2Q5RKR3 745 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ift122Q6NWV3 1182 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dhx37Q6NZL1 1150 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Drc7Q6V3W6 876 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dusp9Q7TNL7 452 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Thap3Q8BJ25 218 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Clec2hQ8C1T8 218 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Slc15a5Q8CBB2 566 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm5591Q8CDK1 855 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Agbl3Q8CDP0 1006 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Grin3bQ91ZU9 1003 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rsph3bQ9DA80 389 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 PorcnQ9JJJ7 461 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Phtf1Q9QZ09 761 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Akt3Q9WUA6 479 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa8.32□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Slc23a4A0A0J9YUX7 615 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ttll8A4Q9F1 832 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 MtrA6H5Y3 1253 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Serpina16D3Z660 418 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm4841E9QAA8 417 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Atp2b1G5E829 1220 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Slc16a2O70324 545 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cbfa2t2O70374 594 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Idh1O88844 414 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gpr25P0C5I1 358 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ptpn22P29352 802 aa8.31□□□□□ -1.08
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Tnni3P48787 211 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.9 ms