RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atad5Q4QY64 1826 aa22.42■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RxrbP28704 520 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkn1P70268 946 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Flt3Q00342 1000 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dgcr8Q9EQM6 773 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ece1Q4PZA2 769 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapk15Q80Y86 549 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp446Q8C9M8 523 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sulf1Q8K007 870 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtpbp10Q8K013 366 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BlmhQ8R016 455 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Caskin2Q8VHK1 1201 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hars2Q99KK9 505 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mov10l1Q99MV5 1187 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt5Q9JKX6 218 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf394Q9Z1D9 521 aa22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr161B2RPY5 545 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clk2O35491 499 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nr3c1P06537 783 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chmp6P0C0A3 200 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nub1P54729 614 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RenbpP82343 430 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srd5a1Q68FF9 255 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbed4Q80WQ9 1168 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Creb3l2Q8BH52 521 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc35f6Q8VE96 372 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zkscan3Q91VW9 553 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces1fQ91WU0 561 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AvenQ9D9K3 342 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gkap1Q9JMB0 366 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ecel1Q9JMI0 775 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc26a3Q9WVC8 757 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tbc1d16A2ABG4 766 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EloblA6PWE0 161 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AfpP02772 605 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Irf3P70671 419 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubxn2bQ0KL01 331 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4952Q5FW57 296 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim21Q62191 470 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zcwpw1Q6IR42 630 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep72Q9D3R3 646 aa22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ercc5P35689 1170 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trappc3lQ4KL14 181 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rccd1Q8BTU7 377 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxl5Q8C2S5 690 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ero1bQ8R2E9 467 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdzd4Q9QY39 772 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf4Q9QZS2 194 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lta4hP24527 611 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LnpkQ7TQ95 425 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClasrpQ8CFC7 668 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btbd6Q8K2J9 488 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr390Q8VEZ7 311 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fgd4Q91ZT5 766 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plod3Q9R0E1 741 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fzd9Q9R216 592 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klrc2Q9WTJ9 238 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MafP54843 370 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam107bQ3TGF2 131 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10392Q3V3I3 114 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd16Q5DTY9 427 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr156Q6PCP7 798 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhot1Q8BG51 631 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il2rbP16297 539 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnni3P48787 211 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grm1P97772 1199 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgre1Q61549 931 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem130Q6NXM3 419 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zbtb5Q7TQG0 670 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcph1Q7TT79 822 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rassf10Q8BL43 508 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppme1Q8BVQ5 386 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap3m2Q8R2R9 418 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tti1Q91V83 1085 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha9Q91Y11 979 aa22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Msh2P43247 935 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Shox2P70390 331 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Drp2Q05AA6 957 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IqceQ6PCQ0 778 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Moxd2Q7TT41 619 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bank1Q80VH0 783 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.6 ms