RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arl5cQ6P068 179 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc9b1Q8C0X2 565 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ftsj1Q8CBC7 324 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eif2b5Q8CHW4 717 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Serpina9Q9D7D2 418 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc46Q9DAP0 323 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fgf22Q9ESS2 162 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Syt10Q9R0N4 523 aa20.08■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc4a11A2AJN7 862 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cavin1O54724 392 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Resp18P47939 175 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc12a1P55014 1095 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adcy6Q01341 1165 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Akap7Q7TN79 314 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B3glctQ8BHT6 489 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prrg2Q8R182 198 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Card14Q99KF0 999 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Klhl10Q9D5V2 608 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab13Q9DD03 202 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scn1aA2APX8 2009 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm3002E9PW72 216 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm10378F6XQQ1 160 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mmp15O54732 657 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cfap157Q0VFX2 523 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 4933416C03RikQ3V063 378 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fbxo43Q8CDI2 640 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ces1fQ91WU0 561 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Chst12Q99LL3 419 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Grtp1Q9D3N8 359 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 SelenooQ9DBC0 667 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Homer2Q9QWW1 354 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Plin4O88492 1403 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vmn2r15L7N2A0 855 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Axin1O35625 863 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mcl1P97287 331 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nrp1P97333 923 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GaltQ03249 379 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tekt4Q149S1 447 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ndst1Q3UHN9 882 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Enpp3Q6DYE8 874 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arhgap11aQ80Y19 987 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rd3Q8BRE0 195 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Amz1Q8BVF9 502 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Noxred1Q9D3S5 366 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbm31yQ9D3U4 565 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 March10E9PX79 788 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 BC049352E9Q2Z6 85 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ptpn22P29352 802 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 B3gat3P58158 335 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tcerg1lQ3B807 590 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Agxt2Q3UEG6 513 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gucy2gQ6TL19 1100 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr389Q7TRX7 312 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Crybg3Q80W49 1005 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Iqcb1Q8BP00 598 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Socs4Q91ZA6 436 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tom1l1Q923U0 474 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tgs1Q923W1 853 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rnf186Q9D241 226 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PirQ9D711 290 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Klra10Q9R1G6 266 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnt2D3Z649 1135 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pbx3O35317 434 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Itgb3O54890 787 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Alkbh1P0CB42 389 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sox5P35710 763 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gnl1P36916 607 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gdf6P43028 454 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd40Q5SUE8 363 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CochQ62507 552 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mysm1Q69Z66 819 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spata20Q80YT5 790 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif2bQ8C0N1 668 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Frat2Q8K025 231 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcdha9Q91Y11 979 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rfx5Q9JL61 658 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slfn14V9GXG1 899 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm973E9Q295 1059 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm10721J3QPJ9 223 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AgtP11859 477 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pkn1P70268 946 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyp3a16Q64481 504 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lmo3Q8BZL8 145 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q8C5C9 218 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tada3Q8R0L9 432 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr385Q8VGT1 312 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc13a3Q91Y63 600 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 A0A286YCQ6 122 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ZxdbA2CE44 873 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Unc13dB2RUP2 1085 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dcpp3L7N259 170 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.4 ms