RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CFB	P00751	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	FOXL1	Q12952	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ADRM1	Q16186	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077		Q6ZSN1	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	AGXT	P21549	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CTSS	P25774	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TRPM2	O94759	1503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GABRD	O14764	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	PHF2	O75151	1096 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	KATNA1	O75449	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RBP3	P10745	1247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GYPE	P15421	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ZNF20	P17024	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	EVA1C	P58658	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CDK17	Q00537	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	FZD9	O00144	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CAPN2	P17655	700 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	NPEPPS	P55786	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ITK	Q08881	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GREM2	Q9H772	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GAST	P01350	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ADRB1	P08588	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	DUSP2	Q05923	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MALL	Q13021	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	CDSN	Q15517	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MED17-223	ENST00000640077	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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