RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637200.1

EFHC1-229, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,896 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-229ENST00000637200 KIF5AQ12840 1032 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 NME8Q8N427 588 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 ERO1AQ96HE7 468 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 CCDC172P0C7W6 258 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 CASQ1P31415 396 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 NCOA4Q13772 614 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 SNX17Q15036 470 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 WDR44Q5JSH3 913 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 SLC35F6Q8N357 371 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 NAGPAQ9UK23 515 aa14.59□□□□□ -0.07
EFHC1-229ENST00000637200 LACTBL1A8MY62 500 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 PHACTR2O75167 634 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 IL18RAPO95256 599 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 USP8P40818 1118 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 TERF1P54274 439 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 KYAT1Q16773 422 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ARID3AQ99856 593 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 GRIN2DO15399 1336 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.58□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 CYP26A1O43174 497 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SGPL1O95470 568 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NAB2Q15742 525 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 VPS36Q86VN1 386 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NPTXRO95502 500 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 INHAP05111 366 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NFICP08651 508 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 GRM5P41594 1212 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SESTD1Q86VW0 696 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 WNT8BQ93098 351 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 FAM81BQ96LP2 452 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 AGPAT1Q99943 283 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ACP6Q9NPH0 428 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.57□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 MYL6P60660 151 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 CUL2Q13617 745 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 JADE1Q6IE81 842 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NOTUMQ6P988 496 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SERINC5Q86VE9 423 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ACAP3Q96P50 834 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 ASB7Q9H672 318 aa14.56□□□□□ -0.08
EFHC1-229ENST00000637200 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms