RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GAS8O95995 478 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ECE1P42892 770 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KCNJ1P48048 391 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NR1H3Q13133 447 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FITM2Q8N6M3 262 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MAML1Q92585 1016 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PPCSQ9HAB8 311 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FEM1BQ9UK73 627 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RAD21O60216 631 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 UNC5CO95185 931 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ICAM1P05362 532 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLCO1A2P46721 670 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ITGA8P53708 1063 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RTP1P59025 263 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MAP3K10Q02779 954 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MGAT5Q09328 741 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SPP2Q13103 211 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PARP6Q2NL67 630 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FAM182BQ5T319 152 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MON1BQ7L1V2 547 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 HOMEZQ8IX15 550 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RDH13Q8NBN7 331 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CNKSR1Q969H4 720 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 BTBD6Q96KE9 485 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 IFT74Q96LB3 600 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SCLT1Q96NL6 688 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CHST7Q9NS84 486 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RAB20Q9NX57 234 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FETUBQ9UGM5 382 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TBX20Q9UMR3 447 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ECE2O60344 883 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ASMTLO95671 621 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CREB1P16220 341 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PTPN7P35236 360 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 KCNJ2P63252 427 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 MOGSQ13724 837 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 USP37Q86T82 979 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 LDHDQ86WU2 507 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CEP57Q86XR8 500 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CCDC89Q8N998 374 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RDM1Q8NG50 284 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 NT5C1BQ96P26 610 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM237Q96Q45 408 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CSRNP1Q96S65 589 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ECT2Q9H8V3 914 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 RLFQ13129 1914 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 PROSCO94903 275 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ACSL3O95573 720 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FDX1P10109 184 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CETPP11597 493 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TAC1P20366 129 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 GCAP28676 217 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CNGA1P29973 690 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 ABCD1P33897 745 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 IFNAR2P48551 515 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 CYP24A1Q07973 514 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 STRN3Q13033 797 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 TKFCQ3LXA3 575 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00598-211ENST00000636621 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms