RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635776.1

SCN1A-210, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCN1A, Length 10,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-210ENST00000635776 MCF2P10911 925 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RASGRF2O14827 1237 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SPAG6O75602 509 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PROSCO94903 275 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SETDB1Q15047 1291 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 EXD1Q8NHP7 514 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 STRA6Q9BX79 667 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 DPH5Q9H2P9 285 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ACKR2O00590 384 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RAD51CO43502 376 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PAEPP09466 180 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 IRF5Q13568 498 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TMEM270Q6UE05 265 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 JAMLQ86YT9 394 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 FAM212AQ96EL1 285 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF560Q96MR9 790 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM7Q9C029 511 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 WHRNQ9P202 907 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PLAAQ9Y263 795 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 COL1A2P08123 1366 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PHF20L1A8MW92 1017 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ADAMTS3O15072 1205 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZBTB7AO95365 584 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CYP1A2P05177 515 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RARGP13631 454 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PLTPP55058 493 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PGM2Q96G03 612 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 A0A1B0GUA9 196 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 GRIN3BO60391 1043 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 NCOA4Q13772 614 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF568Q3ZCX4 644 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ARMCX2Q7L311 632 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SAAL1Q96ER3 474 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 THAP2Q9H0W7 228 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TLDC2A0PJX2 215 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF263O14978 683 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PNPLA4P41247 253 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PPP2R2AP63151 447 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RBP5P82980 135 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CCNG2Q16589 344 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 SPATA33Q96N06 139 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF185O15231 689 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 CENPUQ71F23 418 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 APBB2Q92870 758 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 BORCS6Q96GS4 357 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.85□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 KRT1P04264 644 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 KRT19P08727 400 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 NEFHP12036 1026 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 COMTP21964 271 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 DPP9Q86TI2 863 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.84□□□□□ -1.63
SCN1A-210ENST00000635776 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.84□□□□□ -1.63
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