RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	TTC30A	Q86WT1	665 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	LSMEM2	Q8N112	164 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SMARCD2	Q92925	531 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NOTCH4	Q99466	2003 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CILP	O75339	1184 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RFPL3	O75679	317 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RHO	P08100	348 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT7	P08729	469 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	POU2F2	P09086	479 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CD1E	P15812	388 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GLDC	P23378	1020 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	VIPR2	P41587	438 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IGBP1	P78318	339 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SGF29	Q96ES7	293 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IWS1	Q96ST2	819 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM245	Q9H330	911 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GAREM1	Q9H706	876 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IL21R	Q9HBE5	538 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	THSD1	Q9NS62	852 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GMIP	Q9P107	970 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PNMA2	Q9UL42	364 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MYLK	Q15746	1914 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	N4BP3	O15049	544 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GNS	P15586	552 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MATK	P42679	507 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC1A4	P43007	532 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GRK6	P43250	576 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF33A	Q06730	810 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DSC3	Q14574	896 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB119	Q8N690	84 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MBOAT7	Q96N66	472 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MMS19	Q96T76	1030 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CASS4	Q9NQ75	786 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR27	A2RRH5	827 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	PLA2G6	O60733	806 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	ALDH1A2	O94788	518 aa		7.28	□□□□□ -1.24

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