RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LCHNA4D1U4 455 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMTNL1A8MU46 457 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNJ18B7U540 433 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PBX3P40426 434 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BFSP1Q12934 665 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNJ12Q14500 433 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCAPHQ15003 741 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSMD6Q15008 389 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RASIP1Q5U651 963 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MKNK1Q9BUB5 465 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 THAP9Q9H5L6 903 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBC1D13Q9NVG8 400 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.76■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 THP07101 528 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TPM4P67936 248 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRIK3Q13003 919 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BIRC3Q13489 604 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IQCB1Q15051 598 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CRIPAKQ8N1N5 446 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC43Q8N309 656 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MFSD14AQ96MC6 490 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IKBKBO14920 756 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 B4GALT3O60512 393 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GNA14O95837 355 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TNNC2P02585 160 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT19P08727 400 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BMP8BP34820 402 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PBX2P40425 430 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OR1G1P47890 313 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCLMP48507 274 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SURF1Q15526 300 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR49Q8IV35 697 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CD302Q8IX05 232 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BEST2Q8NFU1 509 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HASPINQ8TF76 798 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RAD9AQ99638 391 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASB7Q9H672 318 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTUS1Q9ULD2 1270 aa15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAPK13O15264 365 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHACTR2O75167 634 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDHD2O94830 711 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CSPG5O95196 566 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ITGB3P05106 788 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CA3P07451 260 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATP1A3P13637 1013 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNE1P15382 129 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 USP37Q86T82 979 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FIBCD1Q8N539 461 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 INSL6Q9Y581 213 aa15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPEF2O14830 753 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGEF15O94989 841 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAVIN2O95810 425 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PIK3CAP42336 1068 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MXI1P50539 228 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PLCB2Q00722 1185 aa15.72■□□□□ 0.11
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYL7Q01449 175 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms