RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ANGPT2O15123 496 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SULT1E1P49888 294 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 STX3Q13277 289 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 CPA5Q8WXQ8 436 aa12.6□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP12.6□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 23.6
TNS1-220ENST00000611415 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 RAD51CO43502 376 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SLC26A4O43511 780 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 MED21Q13503 144 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 NAB2Q15742 525 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 TMEM154Q6P9G4 183 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 TC2NQ8N9U0 490 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 PPCSQ9HAB8 311 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 F5H6K3 240 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 LSP1P33241 339 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 KLRC3Q07444 240 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 OR2W6PQ8NHA6 318 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SLC30A5Q8TAD4 765 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 URGCPQ8TCY9 931 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SEPT8Q92599 483 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SGSM3Q96HU1 749 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ZNF229Q9UJW7 825 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 GLI2P10070 1586 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 AP3B1O00203 1094 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 PJA2O43164 708 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ATP6V1E1P36543 226 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ADNPQ9H2P0 1102 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 MAD2L2Q9UI95 211 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 PSMD3O43242 534 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 CDH16O75309 829 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 APOA1P02647 267 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SERPINB9P50453 376 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 TTLL4Q14679 1199 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SLC10A4Q96EP9 437 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 CYFIP2Q96F07 1278 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 KIF12Q96FN5 646 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ZIM3Q96PE6 472 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 TRIM62Q9BVG3 475 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 LRRC7Q96NW7 1537 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 CYP27B1O15528 508 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 KCNA3P22001 575 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 RAD9BQ6WBX8 426 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ARHGEF26Q96DR7 871 aa12.59□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ZNF609O15014 1411 aa12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 MADDQ8WXG6 1647 aa12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 FMO5P49326 533 aa12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 KLC1Q07866 573 aa12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 SYCP2LQ5T4T6 812 aa12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.39
TNS1-220ENST00000611415 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 NEMP1O14524 444 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 MAP3K10Q02779 954 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 FAM182BQ5T319 152 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 TAGAPQ8N103 731 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 ELMOD1Q8N336 334 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 NEDD1Q8NHV4 660 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 TRIM54Q9BYV2 358 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 UCHL3P15374 230 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 ACTR2P61160 394 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 KRT72Q14CN4 511 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 ADCK1Q86TW2 530 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 C4orf33Q8N1A6 199 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 CMTM5Q96DZ9 223 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 MOSPD1Q9UJG1 213 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 ZHX2Q9Y6X8 837 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 H0Y626 953 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 TRIM16O95361 564 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 ANO4Q32M45 955 aa12.58□□□□□ -0.4
TNS1-220ENST00000611415 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms