RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 STRA6Q9BX79 667 aa18.77■□□□□ 0.6
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HERC3-214ENST00000601319 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-214ENST00000601319 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.77■□□□□ 0.6
HERC3-214ENST00000601319 FNIP2Q9P278 1114 aa18.77■□□□□ 0.6
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HERC3-214ENST00000601319 TEX28O15482 410 aa18.76■□□□□ 0.59
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HERC3-214ENST00000601319 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
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HERC3-214ENST00000601319 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.74■□□□□ 0.59
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HERC3-214ENST00000601319 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-214ENST00000601319 CD302Q8IX05 232 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-214ENST00000601319 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-214ENST00000601319 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-214ENST00000601319 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-214ENST00000601319 APOL5Q9BWW9 433 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.72■□□□□ 0.59
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