RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 RMDN1Q96DB5 314 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT74Q96LB3 600 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 BHMT2Q9H2M3 363 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH3Q9ULD8 1083 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 BACE2Q9Y5Z0 518 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 BRCC3P46736 316 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS3Q68CZ6 603 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP120Q8N960 986 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 UROC1Q96N76 676 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 MUTP22033 750 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCQQ04759 706 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN2BQ14CS0 331 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A9Q2M3M2 681 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKS3Q6ZW76 656 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 KIFAP3Q92845 792 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CD72P21854 359 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC38Q5R3I4 469 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEHQ6S545 545 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf76Q96K31 380 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 HINFPQ9BQA5 517 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 BCO2Q9BYV7 579 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CDT1Q9H211 546 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF13BQ9Y275 285 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOP08100 348 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PFKPQ01813 784 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL10Q7L3V2 364 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 DCLK2Q8N568 766 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LTB4R2Q9NPC1 389 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 NOTCH4Q99466 2003 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM170BA6NMN3 283 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ERI5 159 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC3O43617 180 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM5P41594 1212 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.15e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ROR1Q01973 937 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 NBR1Q14596 966 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 XKR4Q5GH76 650 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SUMF1Q8NBK3 374 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 RUBCNQ92622 972 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 MCRS1Q96EZ8 462 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1024Q9UPX6 916 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 OSTNP61366 133 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKAL1Q6UXT8 129 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRHQ9HD43 1115 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR27A2RRH5 827 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMTOR5O43504 91 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ECI2O75521 394 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 CEBPBP17676 345 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 NPTX2P47972 431 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 YARSP54577 528 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX3P56589 373 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TPRG1Q6ZUI0 275 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS1R3Q7RTX0 852 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 DAW1Q8N136 415 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF461Q8TAF7 563 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO4Q9UKT5 387 aa28.14■■■□□ 2.1
CAPNS1-211ENST00000590874 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF37A1IGU5 675 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC169A6NNP5 214 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 PODXLO00592 558 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 KINO60870 393 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TARSP26639 723 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF528Q3MIS6 628 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 GDE1Q9NZC3 331 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF292O60281 2723 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ABLIM3O94929 683 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LRG1P02750 347 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TANGO2Q6ICL3 276 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCMQ8IYD8 2048 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MIA3Q5JRA6 1907 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PMD0 336 aa28.11■■■□□ 2.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ABLIM1O14639 778 aa28.11■■■□□ 2.09
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