RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 HES2Q9Y543 173 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 C5orf42Q9H799 3197 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 E9PMD0 336 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NRP1O14786 923 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SLC26A4O43511 780 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 B4GALT3O60512 393 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 DKK1O94907 266 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CTSAP10619 480 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ZP2Q05996 745 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 DSC1Q08554 894 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CLUL1Q15846 466 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 DEPTORQ8TB45 409 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 AK8Q96MA6 479 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 TIPINQ9BVW5 301 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 GBP3Q9H0R5 595 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ZBP1Q9H171 429 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 POLD4Q9HCU8 107 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 MIOSQ9NXC5 875 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 N4BP3O15049 544 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NPTXRO95502 500 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 BMP15O95972 392 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 KCNK18Q7Z418 384 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 S1PR5Q9H228 398 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 K7ERI5 159 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 EFEMP2O95967 443 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PRKCBP05771 671 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 AKAP5P24588 427 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 GUCY2CP25092 1073 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 MLH1P40692 756 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 RELBQ01201 579 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 DAW1Q8N136 415 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SUSD6Q92537 303 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 DRC1Q96MC2 740 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ZFP42Q96MM3 310 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PNMA5Q96PV4 448 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 HIP1RO75146 1068 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PTGIRP43119 386 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NPTX2P47972 431 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SCNN1GP51170 649 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PEX3P56589 373 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CASP10Q92851 521 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 APOL6Q9BWW8 343 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 KCND2Q9NZV8 630 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PARP2Q9UGN5 583 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 ARID2Q68CP9 1835 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC169A6NNP5 214 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 AXIN1O15169 862 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC130-211ENST00000589669 SOD2P04179 222 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms