RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 LONP2Q86WA8 852 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 LDHDQ86WU2 507 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MTBPQ96DY7 904 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 THAP11Q96EK4 314 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TC2NQ8N9U0 490 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PGBD4Q96DM1 585 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 REEP2Q9BRK0 252 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ZFATQ9P243 1243 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NPHS2Q9NP85 383 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM154Q6P9G4 183 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 UCHL3P15374 230 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 FMO5P49326 533 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ITIH2P19823 946 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD7P51665 324 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PIM2Q9P1W9 311 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 BRINP3Q76B58 766 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 URGCPQ8TCY9 931 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SULT1E1P49888 294 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MYBP10242 640 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 IL10P22301 178 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KCNA3P22001 575 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TEX12Q9BXU0 123 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KCNA2P16389 499 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ERFP50548 548 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NAB2Q15742 525 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MYMKA6NI61 221 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KLK7P49862 253 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 AURKCQ9UQB9 309 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RAD51CO43502 376 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 PRKCBP05771 671 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KRT8P05787 483 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ACTR2P61160 394 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KYAT1Q16773 422 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ANO4Q32M45 955 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CNPY4Q8N129 248 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TIPINQ9BVW5 301 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D23Q9NUY8 699 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINI2O75830 405 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KRT75O95678 551 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 EFNA5P52803 228 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 C18orf8Q96DM3 657 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 STK4Q13043 487 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CYTH1Q15438 398 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 RNF149Q8NC42 400 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD7Q92527 254 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CASS4Q9NQ75 786 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF26B4DH59 902 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 C4orf33Q8N1A6 199 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF15Q8N660 670 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.46■■□□□ 1.19
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