RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 BCAR1P56945 870 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CDK17Q00537 523 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PPARAQ07869 468 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 STILQ15468 1287 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF11Q86T75 865 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PJA1Q8NG27 643 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SVIPQ8NHG7 77 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TAAR9Q96RI9 348 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DLL4Q9NR61 685 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CHST12Q9NRB3 414 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MYPNQ86TC9 1320 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IL18BPO95998 194 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PFKMP08237 780 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 POU2F2P09086 479 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CYP2C8P10632 490 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GRM1Q13255 1194 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ADAM9Q13443 819 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 LILRA6Q6PI73 481 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SMC5Q8IY18 1101 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MZB1Q8WU39 189 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 HPS3Q969F9 1004 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM209Q96SK2 561 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DIRC2Q96SL1 478 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 BTBD2Q9BX70 525 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NYXQ9GZU5 481 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MTG2Q9H4K7 406 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GCM1Q9NP62 436 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 USP18Q9UMW8 372 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FAM50BQ9Y247 325 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ITGA1P56199 1179 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TEFQ10587 303 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 RTP5Q14D33 572 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 TNIP1Q15025 636 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ANO4Q32M45 955 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 KANK2Q63ZY3 851 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 SYNE4Q8N205 404 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 Q8N3U1 123 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 OR10A5Q9H207 317 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS50Q9UI38 385 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-208ENST00000578600 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 ANO9A1A5B4 782 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SEMA7AO75326 666 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PFKLP17858 780 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 PDCP20941 246 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 IRAK1P51617 712 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 EPHB3P54753 998 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 IL31Q6EBC2 164 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-208ENST00000578600 USP45Q70EL2 814 aa6.64□□□□□ -1.35
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