RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	HYI	Q5T013	277 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	BICD1	Q96G01	975 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PIEZO1	Q92508	2521 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	STK25	O00506	426 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ADAM12	O43184	909 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	FGFR3	P22607	806 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	FSHR	P23945	695 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	BRCC3	P46736	316 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03	4e-6	■■■■□ 21.4
PPP4C-208	ENST00000564966	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PODXL	O00592	558 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	CCL16	O15467	120 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	XYLB	O75191	536 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC12A3	P55017	1021 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SEZ6	Q53EL9	994 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SNX27	Q96L92	541 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	AK8	Q96MA6	479 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PHOX2B	Q99453	314 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	KCND2	Q9NZV8	630 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIP11	Q15643	1979 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH11	P35749	1972 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	CFH	P08603	1231 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	GPBP1	Q86WP2	473 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	SIX5	Q8N196	739 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966		H0Y858	1186 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	CLDN3	O15551	220 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	TOM1L1	O75674	476 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	PROZ	P22891	400 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	BRAP	Q7Z569	592 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966	MTRR	Q9UBK8	725 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PPP4C-208	ENST00000564966		H0YCG3	227 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	BMP15	O95972	392 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	LAMP2	P13473	410 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ARPP19	P56211	112 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	NTHL1	P78549	312 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	RAB33A	Q14088	237 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	VWA8	A3KMH1	1905 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM13A	O94988	1023 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	MYCT1	Q8N699	235 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CNTN3	Q9P232	1028 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ABLIM1	O14639	778 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNE1	P15382	129 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	NUBP1	P53384	320 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	XKR4	Q5GH76	650 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ZPBP2	Q6X784	338 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	NXPE3	Q969Y0	559 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	REEP2	Q9BRK0	252 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CA14	Q9ULX7	337 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966		K7ENM7	598 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC26A4	O43511	780 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ELF1	P32519	619 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	MCM4	P33991	863 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	LIG4	P49917	911 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	CLCN5	P51795	746 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PPP4C-208	ENST00000564966	ARSH	Q5FYA8	562 aa		27.67	■■■□□ 2.02

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