RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	CYP27B1	O15528	508 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CDC14B	O60729	498 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PLAT	P00750	562 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GNAI3	P08754	354 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CFP	P27918	469 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	AK2	P54819	239 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GNAI1	P63096	354 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SNAPC2	Q13487	334 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PLS1	Q14651	629 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	JKAMP	Q9P055	326 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PADI4	Q9UM07	663 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830		A0A1W2PPL8	197 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC43A1	O75387	559 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CHEK2	O96017	543 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MYF5	P13349	255 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SYN1	P17600	705 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GNAT2	P19087	354 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PRDX5	P30044	214 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	HHEX	Q03014	270 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	DUSP8	Q13202	625 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GRM7	Q14831	915 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GPR135	Q8IZ08	494 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MDM1	Q8TC05	714 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TEPSIN	Q96N21	525 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MRI1	Q9BV20	369 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KCNH6	Q9H252	994 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ABCF2	Q9UG63	623 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CFAP69	A5D8W1	941 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830		A6NNZ2	444 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TRIM13	O60858	407 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	POMC	P01189	267 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PEX2	P28328	305 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PCSK1	P29120	753 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TM4SF4	P48230	202 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PIK3CG	P48736	1102 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	AFMID	Q63HM1	303 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PHKB	Q93100	1093 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GJA10	Q969M2	543 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC39A13	Q96H72	371 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TNIP3	Q96KP6	325 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PSMD1	Q99460	953 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	NCDN	Q9UBB6	729 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	DIRC3	C9JPN6	131 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MYO1F	O00160	1098 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	F2RL2	O00254	374 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	HAUS5	O94927	633 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KIF22	Q14807	665 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	VMAC	Q2NL98	169 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	HTR3D	Q70Z44	454 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ST8SIA2	Q92186	375 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MIEF2	Q96C03	454 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	EPC1	Q9H2F5	836 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MED16	Q9Y2X0	877 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CD1A	P06126	327 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	RAP2A	P10114	183 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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