RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 TGFB1I1O43294 461 aa20.52■□□□□ 0.88
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RABGGTA-208ENST00000558954 EXTL3O43909 919 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 IL18RAPO95256 599 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ADRB2P07550 413 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 GPD1LQ8N335 351 aa20.52■□□□□ 0.88
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RABGGTA-208ENST00000558954 FAM212AQ96EL1 285 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF12Q96FN5 646 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 TCF25Q9BQ70 676 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ASB7Q9H672 318 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.52■□□□□ 0.88
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.52■□□□□ 0.88
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RABGGTA-208ENST00000558954 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 PLXNA3P51805 1871 aa20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.878e-6■■■■■ 107
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RABGGTA-208ENST00000558954 KIF4AO95239 1232 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 IRS1P35568 1242 aa20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 TMC7Q7Z402 723 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 CLCNKBP51801 687 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 SPAG1Q07617 926 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 UPP1Q16831 310 aa20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 JADE1Q6IE81 842 aa20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 HASPINQ8TF76 798 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 RABGGTAQ92696 567 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBP1Q9H171 429 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 B3GAT3O94766 335 aa20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 CYP3A5P20815 502 aa20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-208ENST00000558954 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 BEST2Q8NFU1 509 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXL18Q96ME1 805 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 FSD2A1L4K1 749 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF233A6NK53 670 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 EFEMP2O95967 443 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 URODP06132 367 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 CA8P35219 290 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-208ENST00000558954 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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