RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 PFKFB2O60825 505 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 B3GAT3O94766 335 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 RHOP08100 348 aa17.77■□□□□ 0.44
CS-227ENST00000551441 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.77■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 HOXA9P31269 272 aa17.77■□□□□ 0.44
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CS-227ENST00000551441 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
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CS-227ENST00000551441 OSTNP61366 133 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 FZD5Q13467 585 aa17.75■□□□□ 0.43
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CS-227ENST00000551441 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.75■□□□□ 0.43
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CS-227ENST00000551441 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17.75■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 ECI2O75521 394 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 LRG1P02750 347 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 MCM7P33993 719 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 UVSSAQ2YD98 709 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 PDXDC1Q6P996 788 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 PADI6Q6TGC4 694 aa17.74■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.74■□□□□ 0.43
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CS-227ENST00000551441 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.73■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 WASF1Q92558 559 aa17.73■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 EPC1Q9H2F5 836 aa17.73■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 BRD9Q9H8M2 597 aa17.73■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 CACNA1BQ00975 2339 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 WDR27A2RRH5 827 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 NCAM2O15394 837 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 LILRB5O75023 590 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 SEC24AO95486 1093 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 TGM1P22735 817 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 FCARP24071 287 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 ELF1P32519 619 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 CCR2P41597 374 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 ADCY1Q08828 1119 aa17.72■□□□□ 0.43
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CS-227ENST00000551441 ATF7IP2Q5U623 682 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 TMEM130Q8N3G9 435 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 ZSWIM3Q96MP5 696 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 NACC1Q96RE7 527 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 CYP4F11Q9HBI6 524 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 BACE2Q9Y5Z0 518 aa17.72■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa17.71■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 POU2F2P09086 479 aa17.71■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 CYP11B2P19099 503 aa17.71■□□□□ 0.43
CS-227ENST00000551441 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa17.71■□□□□ 0.43
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