RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	DTNB	O60941	627 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SLITRK3	O94933	977 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SEC24A	O95486	1093 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	EDN1	P05305	212 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PROS1	P07225	676 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCNE1	P24864	410 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SOX9	P48436	509 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCR3	P51677	355 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	EPHA7	Q15375	998 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	AXIN1	O15169	862 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	GJA1	P17302	382 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	GDI1	P31150	447 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	BRCC3	P46736	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-222	ENST00000533557	RECQL4	O94761	1208 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ABLIM3	O94929	683 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PTPN2	P17706	415 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LIMK1	P53667	647 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PTGDR	Q13258	359 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KCNB2	Q92953	911 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	GIPC1	O14908	333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TBX3	O15119	743 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	KCNK5	O95279	499 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	TH	P07101	528 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PSMC3	P17980	439 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	SPINK2	P20155	84 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	CLCNKB	P51801	687 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	ROR1	Q01973	937 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	HACE1	Q8IYU2	909 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	IRF7	Q92985	503 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BBS1-222	ENST00000533557	FZD8	Q9H461	694 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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