RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532226.1

TRAF3IP2-AS1-209, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 2,191 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 VPS52Q8N1B4 723 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IGSF21Q96ID5 467 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 BIN1O00499 593 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FAM189A1O60320 539 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 B3GAT3O94766 335 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PIGRP01833 764 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CLTAP09496 248 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CYP2J2P51589 502 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GUCY2FP51841 1108 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FAM193AP78312 1265 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PTPROQ16827 1216 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KANK3Q6NY19 840 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CEP57Q86XR8 500 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 P2RX5Q93086 422 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KIF12Q96FN5 646 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SNX27Q96L92 541 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TLR9Q9NR96 1032 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TTC28Q96AY4 2481 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HIDE1A8MVS5 230 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 I3L4J1 428 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TGFB1I1O43294 461 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TADA2AO75478 443 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZMYND10O75800 440 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KIF4AO95239 1232 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MYL1P05976 194 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ABCD1P33897 745 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PPM1AP35813 382 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DSC1Q08554 894 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TUSC3Q13454 348 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ALCAMQ13740 583 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HVCN1Q96D96 273 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GBP4Q96PP9 640 aa8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.9□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TTC26A0AVF1 554 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RHOBTB3O94955 611 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NFICP08651 508 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SCP2P22307 547 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 WNT7BP56706 349 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NAB2Q15742 525 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 JADE1Q6IE81 842 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SMARCE1Q969G3 411 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MARCH5Q9NX47 278 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CNTN3Q9P232 1028 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CITO14578 2027 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CXCL14O95715 111 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NRIP1P48552 1158 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PLCB3Q01970 1234 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TFF2Q03403 129 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PSMD2Q13200 908 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KCNN1Q92952 543 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.89□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PODXLO00592 558 aa8.88□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 INPPL1O15357 1258 aa8.88□□□□□ -0.99
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SMC2O95347 1197 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms