RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CEP120Q8N960 986 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PACSIN1Q9BY11 444 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 AP5M1Q9H0R1 490 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MYADML2A6NDP7 307 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 OGTO15294 1046 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 VNN1O95497 513 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ALDH1A1P00352 501 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MAGEA9P43362 315 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 OSTNP61366 133 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PRKCZQ05513 592 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ENPEPQ07075 957 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NFRKBQ6P4R8 1299 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MPZL3Q6UWV2 235 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 THNSL1Q8IYQ7 743 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 HELQQ8TDG4 1101 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NLRP7Q8WX94 980 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CPB2Q96IY4 423 aa13.13□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 FAM170AA1A519 330 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.314e-10■□□□□ 10.9
RPS3-217ENST00000531188 FGFR4P22455 802 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 RFX1P22670 979 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PSEN2P49810 448 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CPT1AP50416 773 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 POU5F1BQ06416 359 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ZACNQ401N2 412 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 TMEM192Q8IY95 271 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 FAM212AQ96EL1 285 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CGRRF1Q99675 332 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 Q9Y3F1 56 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 HTTP42858 3142 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 H3BQF6 201 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 GPR25O00155 361 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 HAS3O00219 553 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PJA2O43164 708 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 HLA-DRAP01903 254 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CYBAP13498 195 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 AKR1A1P14550 325 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 BIRC3Q13489 604 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 KIZQ2M2Z5 673 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ICE2Q659A1 982 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 FAM71BQ8TC56 605 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NT5C1BQ96P26 610 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SYT11Q9BT88 431 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CDT1Q9H211 546 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ACP6Q9NPH0 428 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CDC23Q9UJX2 597 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NAGPAQ9UK23 515 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NENFQ9UMX5 172 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 NRCAMQ92823 1304 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ENC1O14682 589 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MOCS3O95396 460 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 USP8P40818 1118 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 KIF22Q14807 665 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 FAM187BQ17R55 369 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SPOPLQ6IQ16 392 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 GLYCTKQ8IVS8 523 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SCLT1Q96NL6 688 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 TSGA10Q9BZW7 698 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MED4Q9NPJ6 270 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 RNF186Q9NXI6 227 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 CTAGE9A4FU28 777 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 TRIM66O15016 1216 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ZEB2O60315 1214 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 SGPL1O95470 568 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PIK3CAP42336 1068 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 MFAP3P55082 362 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 ADAM17P78536 824 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 PURAQ00577 322 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS3-217ENST00000531188 HSP90B2PQ58FF3 399 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms