RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 ALCAMQ13740 583 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPN14Q15678 1187 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 UPP1Q16831 310 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF202O95125 648 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR29P0C7W0 189 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ACOT2P49753 483 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SPAG1Q07617 926 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KYAT1Q16773 422 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 FUT10Q6P4F1 479 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KRBA2Q6ZNG9 492 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 HASPINQ8TF76 798 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 B3GALT6Q96L58 329 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 STK39Q9UEW8 545 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TGFB1I1O43294 461 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TADA2AO75478 443 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 CNPP09543 421 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 DSG1Q02413 1049 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 B3GAT3O94766 335 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 GARTP22102 1010 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 WNT7BP56706 349 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 DPYDQ12882 1025 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 STK4Q13043 487 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 POSTNQ15063 836 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 UROC1Q96N76 676 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KLHL5Q96PQ7 755 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM206Q9H813 350 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIP11Q15643 1979 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PODXLO00592 558 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 C2CD2LO14523 706 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 MYL1P05976 194 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 GLUD2P49448 558 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 GUCY2FP51841 1108 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 AAK1Q2M2I8 961 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 USP41Q3LFD5 358 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 RTP2Q5QGT7 225 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SAAL1Q96ER3 474 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF12Q96FN5 646 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.244e-12■■■■■ 275.7
SH3BP2-225ENST00000513069 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 TEX28O15482 410 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 RPN1P04843 607 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 NFICP08651 508 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 BRCC3P46736 316 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 NDUFV1P49821 464 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 CLUL1Q15846 466 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-225ENST00000513069 JADE1Q6IE81 842 aa16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms