RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494984.5

QARS-223, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene QARS, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-223	ENST00000494984	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	GLUD2	P49448	558 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CYP2J2	P51589	502 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	HYAL1	Q12794	435 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	DPYD	Q12882	1025 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CAMK1	Q14012	370 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CLUL1	Q15846	466 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	KCNN1	Q92952	543 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	HLA-C	Q95604	372 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	B3GALT6	Q96L58	329 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	UROC1	Q96N76	676 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	STRA6	Q9BX79	667 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ZBP1	Q9H171	429 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	STK39	Q9UEW8	545 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.24	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	FSCN2	O14926	492 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	LINC01565	O15544	149 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	KIF20A	O95235	890 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SMC2	O95347	1197 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SOD2	P04179	222 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CTSA	P10619	480 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	KCNE1	P15382	129 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	GART	P22102	1010 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ADSS	P30520	456 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	MCM4	P33991	863 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	GUCY2F	P51841	1108 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	UBE2H	P62256	183 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TFF2	Q03403	129 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	STK4	Q13043	487 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PSMD2	Q13200	908 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	BEST2	Q8NFU1	509 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CIT	O14578	2027 aa		10.23	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984		I3L4J1	428 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	EXTL3	O43909	919 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	FAM189A1	O60320	539 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	IL18RAP	O95256	599 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	KLRC2	P26717	231 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	BRCC3	P46736	316 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	EHHADH	Q08426	723 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	NAB2	Q15742	525 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	UPP1	Q16831	310 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	CD302	Q8IX05	232 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.22	□□□□□ -0.77
QARS-223	ENST00000494984	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77

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