RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 PEX26Q7Z412 305 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ZNF677Q86XU0 584 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 METTL13Q8N6R0 699 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 UBR7Q8N806 425 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TAF4BQ92750 862 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 MS4A14Q96JA4 679 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 NLRP4Q96MN2 994 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 ARID3AQ99856 593 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 FUT8Q9BYC5 575 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 COG5Q9UP83 839 aa21.46■■□□□ 1.03
NELFE-211ENST00000492185 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CLTAP09496 248 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 HOXC6P09630 235 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ZNF286BP0CG31 522 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 PHKA2P46019 1235 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 GPC5P78333 572 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CUL2Q13617 745 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 AMHR2Q16671 573 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 SEZ6Q53EL9 994 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB33Q86T24 672 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.45■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 H3BRB1 525 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CYP1A2P05177 515 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 IQCF3P0C7M6 154 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 BPIFB4P59827 614 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TAF3Q5VWG9 929 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 DAAM2Q86T65 1068 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 RASGEF1CQ8N431 466 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TCHPQ9BT92 498 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.44■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 B4GALT5O43286 388 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ADCY6O43306 1168 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 SASH3O75995 380 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 NCOA4Q13772 614 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 USP6NLQ92738 828 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CDT1Q9H211 546 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 AMFRQ9UKV5 643 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 L1RE1Q9UN81 338 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 KCNK3O14649 394 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 MAP2K7O14733 419 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 B4GALT4O60513 344 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 KRT5P13647 590 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 IGBP1P78318 339 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 MAP2K5Q13163 448 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CHADLQ6NUI6 762 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 USP38Q8NB14 1042 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CPA4Q9UI42 421 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.43■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 IGHA2P01877 340 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 UNGP13051 313 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ZNF132P52740 706 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 DGKDQ16760 1214 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 A6NJR5 290 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 TMOD1P28289 359 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 PPFIA1Q13136 1202 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 GRIK4Q16099 956 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 KRT222Q8N1A0 295 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NELFE-211ENST00000492185 A0A087WZ62 844 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms