RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CNTN2Q02246 1040 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 APBA1Q02410 837 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PRKG1Q13976 671 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TFDP1Q14186 410 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CASP8Q14790 479 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 KYAT1Q16773 422 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 DAAM2Q86T65 1068 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CBWD2Q8IUF1 395 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ABRAQ8N0Z2 381 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 USP38Q8NB14 1042 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PNKPQ96T60 521 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MMP19Q99542 508 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PLVAPQ9BX97 442 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GPR88Q9GZN0 384 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CARD9Q9H257 536 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ABCB6Q9NP58 842 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 STIM2Q9P246 746 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RLFQ13129 1914 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM150BA6NC51 233 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 KCNK3O14649 394 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF185O15231 689 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 STRNO43815 780 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ADCY3O60266 1144 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 HBP1O60381 514 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FTCDO95954 541 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ADRB2P07550 413 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CETPP11597 493 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GLRA2P23416 452 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ADSSP30520 456 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GBP1P32455 592 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PLA2G4AP47712 749 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 DLG4P78352 724 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SP4Q02446 784 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 POU5F1BQ06416 359 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 C2orf54Q08AI8 447 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MAP2K5Q13163 448 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PAK2Q13177 524 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 IRF5Q13568 498 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 TTLL4Q14679 1199 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GJB7Q6PEY0 223 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SV2AQ7L0J3 742 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MAATS1Q7Z4T9 603 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RASGEF1CQ8N431 466 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SLC35G2Q8TBE7 412 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FAM71BQ8TC56 605 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 WHAMMQ8TF30 809 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 COG1Q8WTW3 980 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SCFD2Q8WU76 684 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 BSNDQ8WZ55 320 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 GLG1Q92896 1179 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 OPTNQ96CV9 577 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.272e-13■■■□□ 15.1
HDLBP-243ENST00000488923 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 SYT17Q9BSW7 474 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-243ENST00000488923 VTA1Q9NP79 307 aa7.12□□□□□ -1.27
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