RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 DPYDQ12882 1025 aa28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 HLA-CQ95604 372 aa28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CBWD1Q9BRT8 395 aa28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 TLE6Q9H808 572 aa28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 VWA8A3KMH1 1905 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CXCL14O95715 111 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 RPN1P04843 607 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CLCNKBP51801 687 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM160A1Q05DH4 1040 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP2R3AQ06190 1150 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 COL19A1Q14993 1142 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 POSTNQ15063 836 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 FUT10Q6P4F1 479 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 NELFCDQ8IXH7 590 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 KIAA0895Q8NCT3 520 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM212AQ96EL1 285 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 SAAL1Q96ER3 474 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CLDND1Q9NY35 253 aa28.85■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 VCANP13611 3396 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 C2orf71A6NGG8 1288 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 SOD2P04179 222 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 STK4Q13043 487 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 CLEC17AQ6ZS10 378 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 EP400NLQ6ZTU2 488 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GALT6Q96L58 329 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PCIF1Q9H4Z3 704 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.84■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 UBE4BO95155 1302 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 TADA2AO75478 443 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 ADRB2P07550 413 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 GARTP22102 1010 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PTPN14Q15678 1187 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 DUSP6Q16828 381 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF12Q96FN5 646 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 COG5Q9UP83 839 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C4-202ENST00000483873 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA8IPA6NC78 632 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA8JA6NMD2 632 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 TGFB1I1O43294 461 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 UPP1Q16831 310 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 CTC1Q2NKJ3 1217 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 ARMCX5Q6P1M9 558 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM213AQ9BRX8 229 aa28.82■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 C2CD2LO14523 706 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 GLP2RO95838 553 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNA5P22460 613 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 LTBRP36941 435 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 PNOCQ13519 176 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 BMT2Q1RMZ1 405 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 UROC1Q96N76 676 aa28.81■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 TBX10O75333 385 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GAT3O94766 335 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 GUCY2FP51841 1108 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 ADAM15Q13444 863 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 ZBTB6Q15916 424 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 JADE1Q6IE81 842 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 KANK3Q6NY19 840 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 EFHBQ8N7U6 833 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 STK39Q9UEW8 545 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 IRAK3Q9Y616 596 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 43.1
GTF3C4-202ENST00000483873 PLXNA3P51805 1871 aa28.8■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 PODXLO00592 558 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 LILRB3O75022 631 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 URODP06132 367 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 NFICP08651 508 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 GLUD2P49448 558 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 WNT7BP56706 349 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMD2Q13200 908 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 CHST7Q9NS84 486 aa28.79■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 H3BQ06 376 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 NCK2O43639 380 aa28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 RHOBTB3O94955 611 aa28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
GTF3C4-202ENST00000483873 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms