RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 BFSP1Q12934 665 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 HGSNATQ68CP4 663 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GBP6Q6ZN66 633 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 METTL13Q8N6R0 699 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DEPTORQ8TB45 409 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 USP6NLQ92738 828 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SEMA4DQ92854 862 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 IRF7Q92985 503 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 HVCN1Q96D96 273 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 BICD1Q96G01 975 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM167AQ96KS9 214 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 WDR24Q96S15 920 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GCNT4Q9P109 453 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 DNAI1Q9UI46 699 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 GJD2Q9UKL4 321 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.65□□□□□ -1.34
SKAP2-204ENST00000481204 ANK1P16157 1881 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 K7ERI5 159 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ADCY3O60266 1144 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 HBP1O60381 514 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 PRMT3O60678 531 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 C22orf31O95567 290 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 MMP3P08254 477 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 UCHL3P15374 230 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 KLRC1P26715 233 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ACOT2P49753 483 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 LIG4P49917 911 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 GNG11P61952 73 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 BEX3Q00994 111 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 TNFAIP2Q03169 654 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 STRN3Q13033 797 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 MYBPC2Q14324 1141 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 EPC2Q52LR7 807 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 C4orf17Q53FE4 359 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 IER5Q5VY09 327 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 RNF149Q8NC42 400 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 TRPV1Q8NER1 839 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 PPTC7Q8NI37 304 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 LMO3Q8TAP4 145 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 KAT5Q92993 513 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF358Q9NW07 568 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 GABRQQ9UN88 632 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 MYH10P35580 1976 aa6.64□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 CDC14CA4D256 554 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 H3BRB1 525 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 B4GALT5O43286 388 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 CCP110O43303 1012 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 WIPF1O43516 503 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 AKR1B10O60218 316 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 GFPT2O94808 682 aa6.63□□□□□ -1.35
SKAP2-204ENST00000481204 TBC1D8O95759 1140 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms