RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 NRP1O14786 923 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 NR2F2P24468 414 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 PBX3P40426 434 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC63Q05C16 580 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 NFIL3Q16649 462 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 Q7L0L9 218 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 BEST2Q8NFU1 509 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 C2CD2Q9Y426 696 aa23.61■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 ADRB2P07550 413 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 PLCB3Q01970 1234 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP135Q66GS9 1140 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 JADE1Q6IE81 842 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 USP37Q86T82 979 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXL18Q96ME1 805 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 FNBP1Q96RU3 617 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 LZTS1Q9Y250 596 aa23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP3A5P20815 502 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 RPL9P32969 192 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CENPPQ6IPU0 288 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 MLKLQ8NB16 471 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 RDH13Q8NBN7 331 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 IGSF21Q96ID5 467 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.59■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CETN3O15182 167 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 TADA2AO75478 443 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 ITGB1P05556 798 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CCNE1P24864 410 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 SPAG1Q07617 926 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 PAK1Q13153 545 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM9Q13443 819 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 NAB2Q15742 525 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 DMAC2Q9NW81 257 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
RALGPS1-212ENST00000472427 EPOPA6NHQ4 379 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 B4GALT3O60512 393 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 NFICP08651 508 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 IGFBP4P22692 258 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 CYP24A1Q07973 514 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 POF1BQ8WVV4 589 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 NELFBQ8WX92 580 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 RFXAPO00287 272 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PODXLO00592 558 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAPPC3O43617 180 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 LPXNO60711 386 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TNNC2P02585 160 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 KRT13P13646 458 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 FOSL2P15408 326 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMD6Q15008 389 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA1Q5VX52 437 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TLR9Q9NR96 1032 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIP11Q15643 1979 aa23.56■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 MAPK13O15264 365 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-212ENST00000472427 GRM6O15303 877 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms