RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 BCAR3O75815 825 aa2.15□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 TOMM40O96008 361 aa2.15□□□□□ -2.07
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SHQ1-204ENST00000468347 CD69Q07108 199 aa2.15□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 PAK2Q13177 524 aa2.15□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
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SHQ1-204ENST00000468347 CCT8P50990 548 aa2.09□□□□□ -2.07
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SHQ1-204ENST00000468347 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
SHQ1-204ENST00000468347 LDLRAD1Q5T700 205 aa2.09□□□□□ -2.07
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