RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	STK39	Q9UEW8	545 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		19.33	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	LACTBL1	A8MY62	500 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	NCK2	O43639	380 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PRR29	P0C7W0	189 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KCNE1	P15382	129 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	NAB2	Q15742	525 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	XKR4	Q5GH76	650 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KANK3	Q6NY19	840 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KIF12	Q96FN5	646 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ZBP1	Q9H171	429 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		19.32	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KLRC4	O43908	158 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FAM189A1	O60320	539 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	B3GAT3	O94766	335 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KIF4A	O95239	1232 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	UROD	P06132	367 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CTSA	P10619	480 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	KCNA5	P22460	613 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ADSS	P30520	456 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CLCNKB	P51801	687 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FUT10	Q6P4F1	479 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SAAL1	Q96ER3	474 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	UROC1	Q96N76	676 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	19.3	■□□□□ 0.68	8e-6	■■■■■ 107
USP19-210	ENST00000465902	TTC26	A0AVF1	554 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	LINC01565	O15544	149 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SOD2	P04179	222 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GART	P22102	1010 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	NDUFV1	P49821	464 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	EHHADH	Q08426	723 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PSMD2	Q13200	908 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	B3GALT6	Q96L58	329 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		19.3	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	UBE4B	O95155	1302 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PODXL	O00592	558 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	HOXD13	P35453	343 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	GLUD2	P49448	558 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	DPYD	Q12882	1025 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	STK4	Q13043	487 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	DUSP6	Q16828	381 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	UPP1	Q16831	310 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	USP41	Q3LFD5	358 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CEP57	Q86XR8	500 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CD302	Q8IX05	232 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	EFHB	Q8N7U6	833 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		19.29	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ADAM15	Q13444	863 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PNOC	Q13519	176 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	COL19A1	Q14993	1142 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	PTPN14	Q15678	1187 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	CLUL1	Q15846	466 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	JADE1	Q6IE81	842 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		19.28	■□□□□ 0.68
USP19-210	ENST00000465902	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	19.28	■□□□□ 0.68

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