RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 RTL10Q7L3V2 364 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 UROC1Q96N76 676 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.87■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 I3L4J1 428 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 K7ERI5 159 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 SLC44A4Q53GD3 710 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.86■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CEP250Q9BV73 2442 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 KANSL1LA0AUZ9 987 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 TRAPPC3O43617 180 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 BRCC3P46736 316 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 XKR4Q5GH76 650 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ERMP1Q7Z2K6 904 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CEP120Q8N960 986 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 KXD1Q9BQD3 176 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 NOTCH4Q99466 2003 aa24.85■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 SEC24BO95487 1268 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 GRM5P41594 1212 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 TRAPPC10P48553 1259 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 PDIA5Q14554 519 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 NBR1Q14596 966 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 ING5Q8WYH8 240 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CDT1Q9H211 546 aa24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 CCDC169A6NNP5 214 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 NPTX2P47972 431 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 PEX3P56589 373 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 PRKCQQ04759 706 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 POTEHQ6S545 545 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 DAW1Q8N136 415 aa24.83■■□□□ 1.57
USP4-208ENST00000464168 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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USP4-208ENST00000464168 OSTNP61366 133 aa24.82■■□□□ 1.56
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USP4-208ENST00000464168 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ZNF461Q8TAF7 563 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.82■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 FAM170BA6NMN3 283 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ABLIM3O94929 683 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 NEFLP07196 543 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 CD72P21854 359 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ROR1Q01973 937 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
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USP4-208ENST00000464168 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 GDE1Q9NZC3 331 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.81■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TRIP11Q15643 1979 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 E9PMD0 336 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TBC1D4O60343 1298 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 HIP1RO75146 1068 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ECI2O75521 394 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 PTGDRQ13258 359 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 UBXN2BQ14CS0 331 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
USP4-208ENST00000464168 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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