RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-210ENST00000462363 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ACKR2O00590 384 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CYP26A1O43174 497 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HBP1O60381 514 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RTN2O75298 545 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TOM1L1O75674 476 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CLSTN1O94985 981 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LGALS2P05162 132 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HOXC6P09630 235 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 IQCF3P0C7M6 154 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CYP11B1P15538 503 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CXCR5P32302 372 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ACOT2P49753 483 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LIG4P49917 911 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PEX5P50542 639 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MFAP3P55082 362 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf54Q08AI8 447 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CETN1Q12798 172 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PTP4A2Q12974 167 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 LAMC2Q13753 1193 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TTLL4Q14679 1199 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CCL15Q16663 113 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MORN1Q5T089 497 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CST9Q5W186 159 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 METTL13Q8N6R0 699 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 DEPTORQ8TB45 409 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TCP11Q8WWU5 503 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SEC14L1Q92503 715 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ALG3Q92685 438 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A14Q96JA4 679 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MAML3Q96JK9 1138 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PBKQ96KB5 322 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 FAM81BQ96LP2 452 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA33Q96N06 139 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 NT5C1BQ96P26 610 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ARID3AQ99856 593 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 THAP2Q9H0W7 228 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ACP6Q9NPH0 428 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GDF3Q9NR23 364 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 KAT6AQ92794 2004 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 OGTO15294 1046 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-210ENST00000462363 ASAP2O43150 1006 aa6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms