RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 AMHP03971 560 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MYBP10242 640 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ALAS1P13196 640 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB1AP62820 205 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 HHEXQ03014 270 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 A6NNZ2 444 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MGAT1P26572 445 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PICALMQ13492 652 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GALEQ14376 348 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PLS1Q14651 629 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LLGL1Q15334 1064 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF220Q5VTB9 566 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TCTN3Q6NUS6 607 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 D2HGDHQ8N465 521 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 AOPEPQ8N6M6 819 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 IL17RDQ8NFM7 739 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ST8SIA2Q92186 375 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM176AQ96HP8 235 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GNRHR2Q96P88 292 aa7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 F2RL2O00254 374 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FRS3O43559 492 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MGEA5O60502 916 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 STC2O76061 302 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 POMCP01189 267 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CD1AP06126 327 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDX5P30044 214 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE4AQ14139 1066 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TFAP2CQ92754 450 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MIEF2Q96C03 454 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 RLIMQ9NVW2 624 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GRM6O15303 877 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP27B1O15528 508 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GNAI3P08754 354 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GNAI1P63096 354 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXL1Q12952 345 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA5AQ13591 1074 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF529Q6P280 563 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FUKQ8N0W3 1084 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 USP25Q9UHP3 1055 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PPL8 197 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP69A5D8W1 941 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ANXA1P04083 346 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PIK3CGP48736 1102 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 HS1BP3Q53T59 392 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CERS3Q8IU89 383 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SVIPQ8NHG7 77 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM89AQ96GI7 184 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 NDC1Q9BTX1 674 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 ARMT1Q9H993 441 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-205ENST00000462042 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms