RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CDH7Q9ULB5 785 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TADA2AO75478 443 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CPA1P15085 419 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CAPSQ13938 189 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 RAB33AQ14088 237 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CALCRLQ16602 461 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KSR1Q8IVT5 923 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 LEMD2Q8NC56 503 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DNASE1L2Q92874 299 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GAD1Q99259 594 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TTPALQ9BTX7 342 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GDE1Q9NZC3 331 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TCHHQ07283 1943 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SMTNL1A8MU46 457 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TGM5O43548 720 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ECI2O75521 394 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 POMCP01189 267 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MLH1P40692 756 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NAMPTP43490 491 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 RARRES1P49788 294 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SCNN1GP51170 649 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM29Q14134 588 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TNFRSF25Q93038 417 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 E2F7Q96AV8 911 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MYADMQ96S97 322 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TIPINQ9BVW5 301 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM66O15016 1216 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 B4GALT3O60512 393 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 NEMFO60524 1076 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 THP07101 528 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GLULP15104 373 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GLRA2P23416 452 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ARHGAP8P85298 464 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PPP2R5DQ14738 602 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TPH2Q8IWU9 490 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SPC24Q8NBT2 197 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PJA1Q8NG27 643 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KIFAP3Q92845 792 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MTMR9Q96QG7 549 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 BCO2Q9BYV7 579 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM150BA6NC51 233 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 H7C4K7 107 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ACKR2O00590 384 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 MAN2B1O00754 1011 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SLC26A4O43511 780 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TBC1D4O60343 1298 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 WEE2P0C1S8 567 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FGFR3P22607 806 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 TRAPPC10P48553 1259 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SCRN1Q12765 414 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 PSMD5Q16401 504 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 MAPK6Q16659 721 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ME3Q16798 604 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 RUBCNQ92622 972 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 GTF3C6Q969F1 213 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-204ENST00000440835 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.58□□□□□ -1.36
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