RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436928.7

SENP6-204, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 5

Gene SENP6, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-204ENST00000436928 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 MTRRQ9UBK8 725 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.96□□□□□ -0.01
SENP6-204ENST00000436928 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 LYPLA2O95372 231 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 THP07101 528 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ADRB1P08588 477 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 FGFR3P22607 806 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ARHGAP8P85298 464 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ADCY1Q08828 1119 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 BSNDQ8WZ55 320 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 RTKNQ9BST9 563 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SDHBP21912 280 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CCR2P41597 374 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 NR5A1Q13285 461 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ST3GAL2Q16842 350 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 BORCS6Q96GS4 357 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CHRDQ9H2X0 955 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 TSC2P49815 1807 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.94□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 MARCH6O60337 910 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 TBC1D4O60343 1298 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PSMA5P28066 241 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CLCNKBP51801 687 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 DMWDQ09019 674 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SCRN1Q12765 414 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PPM1JQ5JR12 505 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 DNASE1L2Q92874 299 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 TNFRSF25Q93038 417 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 FZD8Q9H461 694 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GDE1Q9NZC3 331 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GDAQ9Y2T3 454 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 WDR27A2RRH5 827 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GDF9O60383 454 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 HOXC13P31276 330 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 BRCC3P46736 316 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SATB1Q01826 763 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ROR1Q01973 937 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 GAS6Q14393 721 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 FAM187BQ17R55 369 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 UVSSAQ2YD98 709 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 WDR44Q5JSH3 913 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PDXDC1Q6P996 788 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 VITQ6UXI7 678 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 NELL2Q99435 816 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 STK36Q9NRP7 1315 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 OBSL1O75147 1896 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 N4BP3O15049 544 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 NCAM2O15394 837 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 B3GAT3O94766 335 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 UPP1Q16831 310 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP6-204ENST00000436928 ASB16Q96NS5 453 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms