RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA8MH3BSY2 632 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GH1P01241 217 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ARPP19P56211 112 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SNAPC2Q13487 334 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 MYBPC2Q14324 1141 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GJB7Q6PEY0 223 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 NUF2Q9BZD4 464 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GAS2O43903 313 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TOM1L1O75674 476 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 CHUKO15111 745 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 BAG2O95816 211 aa17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 RAD51CO43502 376 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 AKAP3O75969 853 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GUCY2CP25092 1073 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SEC24CP53992 1094 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 NUDCD1Q96RS6 583 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC10BA6NIK2 292 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ITIH2P19823 946 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ARSEP51690 589 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SPDYE2Q495Y8 402 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TRAIPQ9BWF2 469 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ERAP1Q9NZ08 941 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SMIM22K7EJ46 135 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 LSP1P33241 339 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ROR1Q01973 937 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 STAT4Q14765 748 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 OR6J1Q8NGC5 347 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TPCN2Q8NHX9 752 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 HDAC7Q8WUI4 952 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 CCT8L2Q96SF2 557 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 MRIQ9BWK5 157 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TSPY1Q01534 308 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ZBED8Q8IZ13 594 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TTC17Q96AE7 1141 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM55Q9BYV6 548 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM117Q9H0C3 514 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 EPN3Q9H201 632 aa17■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 IL18RAPO95256 599 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 C4orf19Q8IY42 314 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 NFIBO00712 420 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 DCTN3O75935 186 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 COG7P83436 770 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 HDAC11Q96DB2 347 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 VPS39Q96JC1 886 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 KIFC3Q9BVG8 833 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TGFB2P61812 414 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 JAMLQ86YT9 394 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 ATRNO75882 1429 aa16.99■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 MMEL1Q495T6 779 aa16.98■□□□□ 0.31
C9orf172-201ENST00000436881 EFHC2Q5JST6 749 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms