RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 DRC1Q96MC2 740 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 CDH7Q9ULB5 785 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 VWA8A3KMH1 1905 aa29.02■■■□□ 2.24
UPP1-208ENST00000436673 CCL16O15467 120 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 XYLBO75191 536 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 POU2F2P09086 479 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 YARSP54577 528 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ZNF568Q3ZCX4 644 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 C1orf186Q6ZWK4 172 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 KCNK18Q7Z418 384 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 C3orf58Q8NDZ4 430 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SLC7A14Q8TBB6 771 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.01■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 STK25O00506 426 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 TRAPPC3O43617 180 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 TKTP29401 623 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 UVSSAQ2YD98 709 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 FRMD5Q7Z6J6 570 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 TBC1D17Q9HA65 648 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 C17orf75Q9HAS0 396 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 POLIQ9UNA4 740 aa29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 PRR23AA6NEV1 266 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 PROZP22891 400 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 OSTNP61366 133 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ANGPT1Q15389 498 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ANKS3Q6ZW76 656 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.99■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 I3L4J1 428 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ABLIM1O14639 778 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 MCF2P10911 925 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 RFX1P22670 979 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 BRCC3P46736 316 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 PARM1Q6UWI2 310 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 RTL10Q7L3V2 364 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ITFG1Q8TB96 612 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 FGF13Q92913 245 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 FGF14Q92915 247 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SNX27Q96L92 541 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 TIPINQ9BVW5 301 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 DOCK6Q96HP0 2047 aa28.98■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 KCNE1P15382 129 aa28.97■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 GUCY2CP25092 1073 aa28.97■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.97■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 KIF3AQ9Y496 699 aa28.97■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SFI1A8K8P3 1242 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 SLC16A4O15374 487 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 RILPL1Q5EBL4 403 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 HYIQ5T013 277 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 MCTP1Q6DN14 999 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 ACAP3Q96P50 834 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 TCHPQ9BT92 498 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
UPP1-208ENST00000436673 PODXLO00592 558 aa28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 RABEP1Q15276 862 aa28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 SPIRE2Q8WWL2 714 aa28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 PNMA5Q96PV4 448 aa28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 CNTN3Q9P232 1028 aa28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 KCNH3Q9ULD8 1083 aa28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 TRIP11Q15643 1979 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 GPC5P78333 572 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 MTSS1LQ765P7 747 aa28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 PLS3P13797 630 aa28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 KCTD17Q8N5Z5 321 aa28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 SIT1Q9Y3P8 196 aa28.93■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 RPL9P32969 192 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
UPP1-208ENST00000436673 ROR1Q01973 937 aa28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms