RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 RDH13Q8NBN7 331 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 HCSTQ9UBK5 93 aa22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 GBF1Q92538 1859 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGEF15O94989 841 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 NFICP08651 508 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 JADE1Q6IE81 842 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 WDR49Q8IV35 697 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 TMC2Q8TDI7 906 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 GNA14O95837 355 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 LAG3P18627 525 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 TAP1Q03518 808 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 SPATA1Q5VX52 437 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 FAM212AQ96EL1 285 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 KIF12Q96FN5 646 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 SAMD11Q96NU1 681 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.1■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 ANK1P16157 1881 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 CAVIN2O95810 425 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 LRPAP1P30533 357 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 BFSP1Q12934 665 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 USP37Q86T82 979 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 TIFAQ96CG3 184 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 UROC1Q96N76 676 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 CGRRF1Q99675 332 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 PTPRJQ12913 1337 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-201ENST00000425753 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 GALTP07902 379 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 ERVK-21P61565 698 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 SPAG1Q07617 926 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 FNBP1Q96RU3 617 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 THAP9Q9H5L6 903 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 AAASQ9NRG9 546 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 INTS13Q9NVM9 706 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.08■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 IKBKBO14920 756 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 VAMP7P51809 220 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 AP3M2P53677 418 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 BCAR1P56945 870 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF445P59923 1031 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 MYL5Q02045 173 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 BEST2Q8NFU1 509 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF558Q96NG5 402 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 PLVAPQ9BX97 442 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 KRT13P13646 458 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 PPM1AP35813 382 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 BMPR1AP36894 532 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 SLC11A1P49279 550 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 NCAPHQ15003 741 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 UPP1Q16831 310 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-201ENST00000425753 CXorf38Q8TB03 319 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms