RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425609.1

LINC00400-201, long intergenic non-protein coding RNA 400, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00400, Length 547 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00400-201ENST00000425609 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 PPCSQ9HAB8 311 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 STK32BQ9NY57 414 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CPA4Q9UI42 421 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 PCDHA6Q9UN73 950 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 F8W8V4 182 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ARHGAP6O43182 974 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 AHSGP02765 367 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SMARCA1P28370 1054 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CASRP41180 1078 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 FLT3LGP49771 235 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 MFSD14BQ5SR56 506 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 DACT2Q5SW24 774 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 AFMIDQ63HM1 303 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 MCTP2Q6DN12 878 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CARFQ8N187 725 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 EVI5LQ96CN4 794 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 DPH1Q9BZG8 443 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 PADI4Q9UM07 663 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SNX13Q9Y5W8 968 aa5.85□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ZMYM3Q14202 1370 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 A0A1B0GTL3 188 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 F5H423 210 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 TEX33O43247 280 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 MATN4O95460 622 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SBK3P0C264 359 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 BRAFP15056 766 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 STT3AP46977 705 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 PIK3CGP48736 1102 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 DAG1Q14118 895 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 RNF151Q2KHN1 245 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 XP32Q5T750 250 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 SEM1Q6ZVN7 128 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CRB3Q9BUF7 120 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 CERS4Q9HA82 394 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 KCTD3Q9Y597 815 aa5.84□□□□□ -1.47
LINC00400-201ENST00000425609 POM121BA6NF01 834 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 MATN2O00339 956 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 GRM6O15303 877 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 IL18RAPO95256 599 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 TYRP1P17643 537 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 HDCP19113 662 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 ABCB4P21439 1286 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 PPM1AP35813 382 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 SOX8P57073 446 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 APBA1Q02410 837 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 FAM209BQ5JX69 171 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 KRT40Q6A162 431 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 MAML1Q92585 1016 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 RABGGTAQ92696 567 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 MYOCQ99972 504 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00400-201ENST00000425609 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms