RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KXD1Q9BQD3 176 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCO2Q9BYV7 579 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIP11Q15643 1979 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GAT3O94766 335 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52Z1P0C646 297 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCNKBP51801 687 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBXN2BQ14CS0 331 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTL10Q7L3V2 364 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUBCNQ92622 972 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UROC1Q96N76 676 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.5□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KINO60870 393 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST3GAL1Q11201 340 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UPP1Q16831 310 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NT5DC1Q5TFE4 455 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ING5Q8WYH8 240 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT74Q96LB3 600 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMTOR5O43504 91 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAPPC3O43617 180 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECI2O75521 394 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUTP22033 750 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEA9P43362 315 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRCC3P46736 316 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFNA5P52803 228 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCY1B3Q02153 619 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM170BA6NMN3 283 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 I3L4J1 428 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPTLC1O15269 473 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOP08100 348 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROR1Q01973 937 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF174Q15697 407 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECM1Q16610 540 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCLK2Q8N568 766 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIFAP3Q92845 792 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLD4Q9HCU8 107 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDE1Q9NZC3 331 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.47□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRG1P02750 347 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEBPBP17676 345 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD72P21854 359 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRM5P41594 1212 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP120Q8N960 986 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BORCS6Q96GS4 357 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.46□□□□□ -0.09
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP250Q9BV73 2442 aa14.46□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CITO14578 2027 aa14.46□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR27A2RRH5 827 aa14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7ERI5 159 aa14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK4P51957 841 aa14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF568Q3ZCX4 644 aa14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKR4Q5GH76 650 aa14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC38Q5R3I4 469 aa14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms