RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 CNTN3Q9P232 1028 aa22.62■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.62■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 CTSAP10619 480 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 KCNE1P15382 129 aa22.61■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 CLDND1Q9NY35 253 aa22.61■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.61■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 PPP1R2P41236 205 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.6■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 SEZ6Q53EL9 994 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 EFHBQ8N7U6 833 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 IGFLR1Q9H665 355 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 REV3LO60673 3130 aa22.6■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 FAM189A1O60320 539 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 URODP06132 367 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 DUSP6Q16828 381 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.59■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.59■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 IRAK3Q9Y616 596 aa22.59■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 HIDE1A8MVS5 230 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 TADA2AO75478 443 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 KCNA5P22460 613 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 FUT10Q6P4F1 479 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
C4orf48-201ENST00000409248 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.58■■□□□ 1.21
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C4orf48-201ENST00000409248 TISP43B9A030 160 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 KIF4AO95239 1232 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CXCL14O95715 111 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 BMP6P22004 513 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
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C4orf48-201ENST00000409248 TNFSF9P41273 254 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PRCPP42785 496 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GLUD2P49448 558 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 NDUFV1P49821 464 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 NLRP12P59046 1061 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 TFF2Q03403 129 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PTPN14Q15678 1187 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CD302Q8IX05 232 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ADSSL1Q8N142 457 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 ASB2Q96Q27 587 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C4orf48-201ENST00000409248 F8W810 466 aa22.56■■□□□ 1.2
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