RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 CHP1Q99653 195 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SIX2Q9NPC8 291 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 EXOC7Q9UPT5 735 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 USP3Q9Y6I4 520 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ARID2Q68CP9 1835 aa6.57□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 WDR81Q562E7 1941 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.56□□□□□ -1.36
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C6orf48-208ENST00000395788 FANCGO15287 622 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SLC16A4O15374 487 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TLR2O60603 784 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFA10O95299 355 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 C8AP07357 584 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HOXC6P09630 235 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GARTP22102 1010 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GLRA2P23416 452 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PON1P27169 355 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ADSSP30520 456 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MAPK4P31152 587 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP25P42331 645 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 NAMPTP43490 491 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP1Q07960 439 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PDE4CQ08493 712 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 BFSP1Q12934 665 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TTLL4Q14679 1199 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 LY6KQ17RY6 165 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HGSNATQ68CP4 663 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 GPR142Q7Z601 462 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 NEK11Q8NG66 645 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 NUDT8Q8WV74 236 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 USP6NLQ92738 828 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 DENND3A2RUS2 1198 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC53A6NM62 1247 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 EXOC3O60645 756 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TGFB1P01137 390 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 UCHL3P15374 230 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SLC9A1P19634 815 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 ANXA13P27216 316 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CNGA1P29973 690 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 PRKCIP41743 596 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 FMO5P49326 533 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SOX10P56693 466 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 HUNKP57058 714 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 JAM2P57087 298 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 INHBEP58166 350 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 CLDN10P78369 228 aa6.55□□□□□ -1.36
C6orf48-208ENST00000395788 SP4Q02446 784 aa6.55□□□□□ -1.36
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