RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS52Q8N1B4 723 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCE1Q969G3 411 aa16.73■□□□□ 0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 UPP1Q16831 310 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 C2CD2Q9Y426 696 aa16.7■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 IRAK3Q9Y616 596 aa16.7■□□□□ 0.26
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PGGT1B-202ENST00000379615 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 PODXLO00592 558 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF4AO95239 1232 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 PAX3P23760 479 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 GLUD2P49448 558 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 CLCNKBP51801 687 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 MYBPC2Q14324 1141 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB6Q15916 424 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 JADE1Q6IE81 842 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 FUT10Q6P4F1 479 aa16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PGGT1B-202ENST00000379615 RABGGTAQ92696 567 aa16.69■□□□□ 0.26
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