RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 PRSS38A1L453 326 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 DIRC3C9JPN6 131 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 C21orf58P58505 322 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 UBE3CQ15386 1083 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 DIP2AQ14689 1571 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 E9PCH4 1651 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 KIAA0355O15063 1070 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 TYRP1P17643 537 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.67□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 TRPM2O94759 1503 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 MASP2O00187 686 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 NHLH2Q02577 135 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 TEX101Q9BY14 249 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 APBA1Q02410 837 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-204ENST00000367379 TERF2Q15554 542 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.65□□□□□ -1.34
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PTPRC-204ENST00000367379 MARCH11A6NNE9 402 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 B5MCH6 92 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF185O15231 689 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM127O75204 238 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 PPARAQ07869 468 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 METRNLQ641Q3 311 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 BRINP3Q76B58 766 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 LCORLQ8N3X6 602 aa6.64□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 SPON1Q9HCB6 807 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 DCCP43146 1447 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 SEC24CP53992 1094 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 FOXI1Q12951 378 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRC-204ENST00000367379 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 PTPRUQ92729 1446 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 NINJ1Q92982 152 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-204ENST00000367379 NAIPQ13075 1403 aa6.62□□□□□ -1.35
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