RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CDH16O75309 829 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CDR2Q01850 454 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 APPL2Q8NEU8 664 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM54Q9BYV2 358 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 E2F6O75461 281 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A1P19634 815 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ITIH2P19823 946 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 REREQ9P2R6 1566 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TMCC1O94876 653 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SETSIPP0DME0 302 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RARBP10826 455 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF3Q86WH2 238 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.38■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PHF2O75151 1096 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A27O95847 323 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 EGFL8Q99944 293 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PQJ5 194 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 AGTP01019 485 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 BARGINQ6ZT62 677 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MED15Q96RN5 788 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ATP9BO43861 1147 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ANP32DO95626 131 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 DLC1Q96QB1 1528 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF185O15231 689 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 FGFR4P22455 802 aa21.37■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP69A5D8W1 941 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RMDN1Q96DB5 314 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 NDE1Q9NXR1 346 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3R2O00459 728 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 KCNN4O15554 427 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 FOXP3Q9BZS1 431 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 WWP1Q9H0M0 922 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R37O75864 691 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM253P0C7T8 217 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SNAPC2Q13487 334 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 AP1ARQ63HQ0 302 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PGBD4Q96DM1 585 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZBBXA8MT70 800 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SCFD2Q8WU76 684 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SPON1Q9HCB6 807 aa21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 IL18RAPO95256 599 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ESRRBO95718 433 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DRAP01903 254 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 APRTP07741 180 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 RDM1Q8NG50 284 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TRABDQ9H4I3 376 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CD4P01730 458 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 CHST13Q8NET6 341 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 GYPCP04921 128 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 STYK1Q6J9G0 422 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A14Q96JA4 679 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.35■■□□□ 1.01
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms