RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TRABDQ9H4I3 376 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CFAP69A5D8W1 941 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CLIC2O15247 247 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CLDN3O15551 220 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TNNI2P48788 182 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 BPIFB4P59827 614 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 VPS52Q8N1B4 723 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 COA7Q96BR5 231 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.11■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 HAUS5O94927 633 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ABHD2P08910 425 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 PRDX5P30044 214 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 FMO5P49326 533 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 DSG1Q02413 1049 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 IZUMO2Q6UXV1 221 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 RINLQ6ZS11 566 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 NAT14Q8WUY8 206 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CHST7Q9NS84 486 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 RFC4P35249 363 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 FYB2Q5VWT5 728 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ECSITQ9BQ95 431 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa23.1■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 COL4A1P02462 1669 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 MARCH6O60337 910 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1G1O75348 118 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CRABP2P29373 138 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 PPP2R5CQ13362 524 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ATF2P15336 505 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 AMPD1P23109 780 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 MTA1Q13330 715 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 LLGL1Q15334 1064 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TDRPQ86YL5 185 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 LZICQ8WZA0 190 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.09■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TYROBPO43914 113 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 MED24O75448 989 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 CCDC166P0CW27 439 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 KCNA1Q09470 495 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 RFWD2Q8NHY2 731 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 SMC6Q96SB8 1091 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 REEP2Q9BRK0 252 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.08■■□□□ 1.29
OPN3-201ENST00000366554 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 A6NJR5 290 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 SPOPO43791 374 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 CA4P22748 312 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 DBN1Q16643 649 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 CBWD6Q4V339 395 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 SPATA24Q86W54 205 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 DYDC2Q96IM9 177 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 FNBP1Q96RU3 617 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 HEY2Q9UBP5 337 aa23.08■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 SCN7AQ01118 1682 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 F8W8V4 182 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 TGFB1I1O43294 461 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 ITGA2BP08514 1039 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 VAV1P15498 845 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 DESP17661 470 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 ADCY8P40145 1251 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 RAP1GDS1P52306 607 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 FAM186BQ8IYM0 893 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 TTC25Q96NG3 672 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 SENP1Q9P0U3 644 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.07■■□□□ 1.28
OPN3-201ENST00000366554 SLC26A4O43511 780 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms