RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SNX27Q96L92 541 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 POMKQ9H5K3 350 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CHST7Q9NS84 486 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 NR2E1Q9Y466 385 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TECTAO75443 2155 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TCHHQ07283 1943 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PRR33A8MZF0 331 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SCP2P22307 547 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 27.3
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF131P52739 623 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RTP2Q5QGT7 225 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 KANK3Q6NY19 840 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZPBP2Q6X784 338 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 USP49Q70CQ1 688 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 GPR65Q8IYL9 337 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MYCT1Q8N699 235 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 UROC1Q96N76 676 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CLIC6Q96NY7 704 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ACAP3Q96P50 834 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 USP28Q96RU2 1077 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TTPALQ9BTX7 342 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PARVGQ9HBI0 331 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CNTN3Q9P232 1028 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 STK17AQ9UEE5 414 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DPP7Q9UHL4 492 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PIEZO1Q92508 2521 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MYO10Q9HD67 2058 aa8.38□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN3O15551 220 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R37O75864 691 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 KCNE1P15382 129 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DDIT3P35638 169 aa8.37□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MCL1Q07820 350 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SLC39A14Q15043 492 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD5Q16401 504 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 UPP1Q16831 310 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 XKR4Q5GH76 650 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PDXDC1Q6P996 788 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 GPR149Q86SP6 731 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CEP57Q86XR8 500 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PALB2Q86YC2 1186 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.37□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 KCNN1Q92952 543 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 FNIP2Q9P278 1114 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP45Q9UL16 551 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TBX20Q9UMR3 447 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PODXLO00592 558 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TGM5O43548 720 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TRAK2O60296 914 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RFPL2O75678 378 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 B3GAT3O94766 335 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 C1RP00736 705 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 PIGRP01833 764 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31D3P0C874 917 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 CXCL8P10145 99 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 MYBP10242 640 aa8.36□□□□□ -1.07
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