RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3-201ENST00000329553 MGAMO43451 1857 aa21.84■■□□□ 1.09
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RIPPLY3-201ENST00000329553 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.83■■□□□ 1.09
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RIPPLY3-201ENST00000329553 BIRC3Q13489 604 aa21.83■■□□□ 1.09
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.83■■□□□ 1.09
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RIPPLY3-201ENST00000329553 Q9Y3F1 56 aa21.83■■□□□ 1.08
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RIPPLY3-201ENST00000329553 SLC20A1Q8WUM9 679 aa21.82■■□□□ 1.08
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RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM212AQ96EL1 285 aa21.82■■□□□ 1.08
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.82■■□□□ 1.08
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RIPPLY3-201ENST00000329553 ZEB2O60315 1214 aa21.81■■□□□ 1.08
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RIPPLY3-201ENST00000329553 NCOA4Q13772 614 aa21.78■■□□□ 1.08
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RIPPLY3-201ENST00000329553 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY3-201ENST00000329553 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.78■■□□□ 1.08
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