RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 GH2P01242 217 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SDC4P31431 198 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINB10P48595 397 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PSMD7P51665 324 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FLOT2Q14254 428 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 JAMLQ86YT9 394 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PIGBQ92521 554 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 BBOX1O75936 387 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 IL10P22301 178 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 39.2
SBNO1-201ENST00000267176 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 REEP2Q9BRK0 252 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ALG6Q9Y672 507 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FMO5P49326 533 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 DSG1Q02413 1049 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SZRD1Q7Z422 152 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ABI1Q8IZP0 508 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CNBD2Q96M20 576 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0G2JLW4 131 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 E5RI56 91 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PDIA5Q14554 519 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 GRM4Q14833 912 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CEP55Q53EZ4 464 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FAM196BA6NMK8 535 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 USP11P51784 963 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 RNF217Q8TC41 542 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CPA2P48052 419 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 HIC2Q96JB3 615 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TRIP11Q15643 1979 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 B2RBV5 119 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KRT34O76011 436 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ALX1Q15699 326 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 DPP9Q86TI2 863 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SULF1Q8IWU6 871 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 HACD3Q9P035 362 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ABCC3O15438 1527 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ADCY3O60266 1144 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MTRQ99707 1265 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 AIM2O14862 343 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TRPC1P48995 793 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TAP1Q03518 808 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 POTEAQ6S8J7 498 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.67□□□□□ -1.34
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